Ve třetím díle SPY KIDS 3D - Game Over, tajní agenti Carme a Juni jsou opěT zpátky na jejich dosud nejšílenější misi. Když se Carmen ztratí v nové videohře vytvořenou žroutem energie a času ToyMakerem, Juni je povolán do akce. Během cesty virtuálním světěm videohry musí Juni bojovat v stále vyšších a těžších úrovních, než se mu podaří najít Carmen, aby mohli společnými silami definitivně přelstít a doknočit ToyMakerovou pátou úroveň a vypnout hur dříve než „HRA“ skončí pro všechny a pohltí celý svět.