Příběh navazuje na první film s názvem Donnie Darko. Nyní, o sedm let později, Donnieho mladší sestra Samantha, zdánlivě osamocená a ztracená, utekla z domova společně se svou kamarádkou Corey, zničená smrtí svého bratra. Utápí se ve smutku, nedokáže snít, a propadá se hlouběji a hlouběji do temnot spánku. A až temnota pohltí světlo hvězd, noc ovládnou noční můry.